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荧光PCR法检测RNasin性能效果

 一.   服务介绍                          

       荧光PCR检测

目的:


       对RNasin性能效果进行检测及评估。


  二.实验材料以及设备                    


       模板RNA:大鼠肌肉组织RNA检测


       引物:Rat β-acting:Forward CCCATCTATGAGGGTTACGC


                 Reverse TTTAATGTCACGCACGATTTC 


       RNase:50mg/ml(simgen)


       RNasin:40U/µl


       cDNA第一链合成试剂盒(simgen)、2×SYBR Green PCR mix(simgen)


设备


       ABI 7000 荧光PCR仪、普通PCR仪、离心机及移液器

其他耗材


       0.6ml离心管,八连排管,RNase-free吸头,一次性手套及防护用品和纸巾。


  三.实验方法:                         


       利用逆转录反应将RNA逆转录成cDNA及SYBR Green荧光PCR方法对RNasin产品的性能效果进行检测评估。


设计思路:


       1. 编号1-4为测试同一批RNasin的性能,1号与3号是测试相同RNA量和RNase量,加不加RNasin对cDNA合成的影响,即RNasin抑制RNase的活性效果。


       2. 4号是表示在不添加RNase和RNasin时的空白对照。


       3. 2号与3号是测试在相同RNA量和RNasin量的条件下,改变RNase的量,RNasin对不同量的RNase的抑制效果有什么变化。
 

实验步骤:


       1.将模板RNA在冰上解冻;5×gDNA Buffer、RNasin、RNA(500ng/ul)、RNase、RNA-Free H2O、5×RT Buffer、RT-Enzyme mix、RT-Primer mix 、2×SYBR Green PCR Mix、引物、在室温(15-25℃)解冻,解冻后迅速置于冰上。使用前将每种溶液涡旋振荡混匀,简短离心以收集残留在管壁的液体。
    
注:RNase稀释需在抽风口或远离PCR操作室的实验室。
       2. 按照表1的基因组DNA的去除体系配制混合液,彻底混匀。简短离心,并置于42℃,孵育30min,以保证RNase有充分时间去降解RNA。然后置于冰上放置。

       表1 gDNA去除反应体系


       试剂编号
               2  

1 gDNA去除反应体系

试剂编号

1

2

3

4

5×gDNA Buffer(µl)

2

2

2

2

RNA(µl)*1

4

4

4

4

RNase(ng)*2

2

20

2

RNasin(µl)*3

2

2

RNA-Free H2O(µl)

补足到10µl


注:


        1. RNA的浓度是500ng/µl,RNA的浓度不能太低,且RNA需在RNase之前添加,否则可能被RNase降解完从而在荧光PCR上反映不出差异。

       2. RNase的浓度分别为1ng/µl和10ng/µl,故在加入RNase时均加入2µl,保证不同的量相同体积,以减少误差,在加RNase的时候应尽量在无RNase的环境中添加,以免环境中RNase过多而导致RNA降解严重从而在荧光PCR上反映不出差异。


        3. RNasin的浓度为40U/µl,添加RNasin应在加RNA之前添加。后续cDNA合成步骤参考cDNA第一链合成试剂盒(simgen)说明书操作。所得cDNA稀释5倍,置于冰上备用。


       荧光PCR步骤参考2×SYBR Green PCR Mix(simgen)说明书操作。


       将稀释好的cDNA模板按照5µl/管加入到荧光PCR反应体系混合液中,进行荧光PCR扩增,观察实验结果。

     

      (本文转载丁香园)


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