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【课题实验整体外包】-常见SPF级小鼠和大鼠肠道菌群多样性研究

目的:研究常见SPF级小鼠和大鼠的肠道菌群多样性。

方法:分别采集广东地区三家实验动物生 产单位的C57BL/6、ICR、BALB/c小鼠和Wistar、SD大鼠的盲肠内容物样品,用细菌16SrDNA通用引物扩增V4-V5 区域,采用IlluminaMiseq2×300bp测序平台进行测序,使用生物信息学方法进行微生物群落分析、Alpha多样性 分析与Beta多样性分析。

结果:对序列去杂优化后OTU聚类分析,稀释性曲线说明本次测序的数据量合理;实验 小鼠和大鼠肠道菌群共分成八个门,其中拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)占据主要地位,属水平上 主要是拟杆菌属(Bacteroides)、Hungatella、副杆状菌属(Parabacteroides)、乳酸杆菌属(Lactobacillus)等;样品间差异 性分析显示相同设施来源动物的菌群组成相似性较高;Alpha分析结果显示来源于同种设施的动物物种丰富度相 近;Beta分析显示相同设施动物的肠道菌群差异较小,但品系对肠道菌群差异性有所影响。

结论:不同来源设施 的饲养环境是动物肠道菌群多样性的主要影响因素,不同品系对肠道菌群多样性有一定影响。

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